Можно ли изменить атрибуты папки не через FTP?

Да. Посетите cPanel, перейдите по ссылке "Менеджер Файлов", выберите слева папку, на которую надо поставить атрибуты.
Нажмите в появившемся справа меню на ссылку "Change Permissions". Установите атрибуты и сохраните изменения.