Базовое управление осуществляется через VMmanager, вы можете выключить, перезагрузить, приостановить работу машины. Для доступа к консоли сервера в VMmanager присутствует VNC клиент.
Доступ к серверу возможен через ssh клиент, мы рекомендуем использовать Putty:
http://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/download.html
IP виртуального сервера и root-пароль указаны в письме об активации.
Для тонкой настройки сервера, установки служб, управления сайтами необходимо установить на сервер панель управления. Мы рекомендуем использовать ispmanager или whm/cpanel, лицензию панели вы можете приобрести при заказе VDS либо позже из биллинг-аккаунта, раздел "дополнительные услуги".
Инструкции по установке панелей:
http://doc.ispsystem.ru/index.php (в панели есть готовый рецепт ОС с ISPmanager, используйте переустановку ОС с рецептом)
https://documentation.cpanel.net/display/ALD/Installation+Guide
Панель ISP доступна по порту 1500. cPanel/WHM по 2086/2087. Обе панели после установки доступы по root паролю.
По своему усмотрению, вы можете установить любую панель управлению, в том числе бесплатную: webmin, vesta и пр.