На главной страничке cPanel показывает, что на сервере занято места больше, чем суммарно отображается в информации по объему папок на сервере.

В объем дискового пространства входят:

Все файлы и папки в директории /public_html/
Содержимое баз MySQL
Письма, находящиеся в почтовых ящиках (включая главный аккаунт)
Файлы статистики из папки /tmp.