Да, Вы можете использовать разделы "Настройка Python приложений" и "Настройка Ruby приложений" в cPanel.
После добавления Python приложения нужная версия будет доступна для web в папке приложения. Для работы с выбранной версией нужно в ssh выполнить команду для входа в виртуальную среду вида:
source /home/bh*****/virtualenv/python/3.6/bin/activate. Команда указана на странице приложения в cPanel. После выбранная версия будет доступна по /home/bh*****/virtualenv/python/3.6/bin/python3
Указанные пути приведены в качестве примера, модифицируйте в зависимости от версии.
Принцип работы с Ruby приложениями аналогичный.
Если в Вашей панели указанные разделы отсутствуют обратитесь в поддержку через Стол помощи в биллинг аккаунте.